Si los fangos deshidratados no se aprovechan, es necesaria su eliminación en las condiciones adecuadas por métodos cuya aplicación también dependerá, en gran medida, del contenido en humedad.
El lagunaje se utiliza para fangos de alto contenido en humedad, que se vierten en estanques de tierra, donde se produce un drenado y una evaporación.
El vertido controlado de fangos de bajo contenido en humedad se lleva a cabo en vertederos controlados de residuos sólidos.
El relleno de terreno se puede llevar a cabo con fangos secos con total seguridad aprovechando minas abandonadas u otras estructuras similares.
La incineración permite transformar toda la materia orgánica contenida en el fango en productos gaseosos y cenizas inorgánicas. Se lleva a cabo en hornos, eliminándose las cenizas en un vertedero controlado y los gases de combustión, tras el tratamiento adecuado, pueden evacuarse a la atmósfera.