Para favorecer el proceso posterior de desecación de los fangos, se suelen someten éstos a operaciones de acondicionamiento, para mejorar las características físicas de los sólidos susceptibles de ser separados.
El acondicionamiento químico da como resultado la coagulación de los sólidos y la liberación del agua absorbida, aplicándose antes de las operaciones de filtración.
El acondicionamiento térmico consiste en calentar el fango durante cortos períodos de tiempo a unos 200ºC. Como resultado se produce la coagulación de los sólidos y la rotura de la estructura de gel; además se produce también una esterilización y una desodorización.